تأسس الأرشيف الوطني عام 1968م بتوجيهات المغفــور له – بإذن الله – الشيــخ زايد بن سلطان آل نهيان أول رئيس لدولة الإمارات العربية المتحدة تحت اسم مركز الوثائق والبحوث. وبعد أربعين سنة من تأسيسه أصدر صاحب السمو الشيخ خليفة بن زايد آل نهيان، رئيس الدولة – حفظه الله – القانون الاتحادي رقم (7) لعام 2008 كلّف المركز بمسؤولية الأرشيف الوطني لدولة الإمارات العربية المتحدة، وحدد القانون مهمة المركز بجمع، وحفظ، وأرشفة الوثائق؛ لتعزيز الوعي الثقافي والتاريخي، وإتاحة المواد القَيّمة للباحثين وقد تغير إسمه إلى المركز الوطني للوثائق والبحوث.
وفي العام 2014، أصدر الشيخ خليفة بن زايد آل تهيان المرسوم الاتحادي رقم (1) للعام 2014 غير بموجبه إسم المركز إلى الأرشيف الوطني