أنشئ مركز دراسات البحرين (مركز الدراسات التاريخية سابقًا) بناءً على قرار مجلس أمناء جامعة البحرين رقم 31/2008م الصادر فى 14 إبريل 2008م/ 8 ربيع الثاني 1429هـ، ونظرًا لتعدد المهام الموكولة إلى المركز بما يتعدى نطاق الاختصاص التاريخي، فقد ارتؤي تغيير تسميته إلى "مركز دراسات البحرين" بناءً على قرار مجلس جامعة البحرين رقم 1246/2013م الصادر فى 12 يونيو 2013م/ 3 شعبان 1434هـ، وقرار مجلس أمناء جامعة البحرين رقم 170/2016م الصادر فى 7 يونيو 2016م/ 2 رمضان 1437هـ.
وينتمي مركز دراسات البحرين من حيث تكوينه وطبيعته العلمية إلى حقل العلوم الإنسانية، فهو يؤدي مهامه فى إنجاز الأبحاث والدراسات وعقد المؤتمرات والندوات والمحاضرات العلمية فى حقول العلوم الإنسانية المعروفة مثل التاريخ والجغرافيا والأنثروبولوجيا والاجتماع والسياسة والاقتصاد. ويسعى المركز من خلال نشاطه العلميّ إلى بحث ودراسة قضايا البحرين بشكل عام، ومد جسور التواصل بين المتخصّصين الأكاديميين فى العلوم الإنسانيّة وصانعي القرار، إضافةً إلى مراكز البحث الخليجية والعربيّة والعالميّة.
ويُعنى المركز بتشخيص وتحليل قضايا البحرين، التاريخية والجغرافية والأنثروبولوجية والاجتماعية والسياسية والاقتصادية، ويطرح التحدّيات التي تواجه البحرين على مختلف هذه المستويات، فضلًا عن دراسة علاقات البحرين بمحيطها الإقليمي والعربي والدولي، بجميع أوجهها السياسيّة والاقتصاديّة وغيرها. كما يُعنى المركز بالتحليل والنقد للقضايا والمسائل النظريّة، وخاصّةً بإسقاطاتها المباشرة على الخطاب الأكاديميّ والسياسيّ المُوجِّه للدّراسات المختصّة بالبحرين.
ويصدر المركز أبحاثًا ودراساتٍ وتقاريرَ، ويعقد مؤتمراتٍ وورش عمل وتدريب وندوات موجّهة للمختصّين، ويسعى لنشر إصداراته باللّغتين العربيّة والإنكليزية ليتسنّى للباحثين الاطّلاع عليها.